Selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS), les maladies infectieuses émergentes sont définies comme des maladies causées par des agents pathogènes récemment identifiés ou auparavant inconnus, responsables de problèmes de santé publique au niveau local et international. Cette définition peut également être appliquée à la médecine vétérinaire.

Ces dernières années, grâce à l’utilisation de techniques avancées de biologie moléculaire, comme le séquençage de nouvelle génération (NGS), de nouveaux virus ont été identifiés chez le chien et le chat. Parallèlement, certains virus déjà connus ont vu leur distribution géographique s’étendre ou l’incidence des cas cliniques augmenter.

Parvovirus émergents

En plus des souches classiques de parvovirus du chien (Canine parvovirus, CPV) et du chat (Feline parvovirus, FPV) appartenant au Carnivore protoparvovirus 1, d’autres parvovirus méritent une attention particulière : les bufavirus et les bocaparvovirus.

  • Les bufavirus du chien (CBuV) et du chat (FBuV) (Carnivore protoparvovirus 3) constituent une nouvelle espèce virale au sein du genre Protoparvovirus.
    • CBuV a été identifié pour la première fois en 2011 chez une portée de chiots de cinq mois présentant des signes respiratoires.
    • FBuV a été décrit en 2017 chez des chats atteints de formes respiratoires et/ou digestives.

Chez les carnivores domestiques, ces virus semblent présenter un tropisme pour l’appareil respiratoire, même si certaines études suggèrent également un rôle entéropathogène.

  • Les bocavirus provoquent des maladies chez plusieurs espèces animales, et chez le chat ils comprennent plusieurs espèces virales. Les bocaparvovirus félins (FBoV) ont été décrits pour la première fois en 2012 à Hong Kong et regroupent trois principaux génotypes :
    • FBoV-1, FBoV-2 et FBoV-3, parmi lesquels
    • FBoV-1 (Carnivore bocaparvovirus 1) est clairement associé à des formes sévères de diarrhée féline.

Astrovirus du chien et du chat

Les astrovirus canins (CAstV) et félin (FAstV) sont largement répandus dans les populations de chiens et de chats.

  • Pour CAstV, une prévalence plus élevée a été observée chez les chiots présentant des signes gastro-entériques comparativement aux chiots sains, et l’intensité de l’excrétion virale semble corrélée aux manifestations cliniques.
  • Chez le chat, ces virus semblent exacerber les signes cliniques causés par d’autres pathogènes, notamment le FPV.
Photo : Particules d’astrovirus visualisées au microscope électronique.

Rotavirus de groupe A

Les rotavirus de groupe A sont impliqués dans des diarrhées chez de nombreuses espèces animales, y compris chez le chien et le chat.
Les rotavirus félins sont particulièrement importants non seulement pour leur impact sur la santé féline, mais aussi pour leur potentiel zoonotique : certains génotypes félins, notamment G3P[9] et G6P[8], ont été associés à des épidémies étendues de rotaviroses chez l’enfant dans différentes régions du monde.

Circovirus chez le chien et le chat

Un autre virus associé à des entérites est le circovirus félin (FeCV), similaire au circovirus canin (CaCV), dont le rôle dans la survenue de diarrhée aiguë est bien documenté.

  • CaCV est reconnu comme un copathogène important en association avec des agents primaires comme le CPV ou le coronavirus canin.
  • Pour FeCV, les données sur la pathogénicité sont encore en développement, mais les éléments disponibles suggèrent un comportement biologique proche de celui observé chez le chien.

Morbillivirus félin (FeMV)

Chez le chat, le morbillivirus félin (FeMV) suscite un intérêt croissant en médecine vétérinaire.
Ce virus est antigéniquement lié au virus du cimurro canine et au virus du morbillo humain. Il circule de façon significative dans les colonies et élevages, se transmettant principalement par contact avec des urines infectées.

FeMV a été associé à la maladie rénale chronique (MRC), provoquant surtout une néphrite tubulo-interstitielle, qui conduit progressivement à une perte de fonction rénale.

  • Les premières phases de l’infection sont souvent asymptomatiques ou peu spécifiques.
  • Les signes cliniques évidents (polyurie/polydipsie, amaigrissement, léthargie) apparaissent généralement lorsque le dommage rénal est déjà avancé.

Domestic cat hepadnavirus (DCH)

Un autre virus émergent chez le chat est le Domestic cat hepadnavirus (DCH), identifié pour la première fois en 2018 en Australie.
Ce virus a longtemps été apparenté au virus de l’hépatite B humaine. Il a été détecté tant dans le sang que dans le tissu hépatique, avec une prévalence plus élevée chez les chats co-infectés par des rétrovirus et présentant des anomalies hépatiques.

Ce virus a été associé à un dommage hépatique, les chats présentant un profil biochimique hépatique altéré ayant environ trois fois plus de chances d’être positifs pour DCH que ceux ayant des paramètres normaux.
À l’instar de l’infection par l’HBV humain, l’infection par DCH pourrait déclencher une hépatite chronique immunomédiée, caractérisée par nécrose, régénération et fibrose, évoluant vers la cirrhose voire le carcinome hépatocellulaire.

Virus neurotropes chez le chat

Deux virus neurotropes méritent également d’être mentionnés chez les carnivores domestiques, particulièrement chez le chat :

  • Bornavirus (BoDV)
  • Rustrela virus (RusV)

Ces virus partagent une caractéristique commune : ils utilisent des espèces réservoirs sauvages (taupes et rongeurs) pour maintenir l’infection dans la nature.

  • BoDV possède un large spectre d’hôtes, affectant non seulement les félidés domestiques et sauvages, mais aussi une variété de mammifères (humains inclus) et des oiseaux.
  • Des cas de maladies neurologiques causées par BoDV et RusV ont été fréquemment observés chez le chat.
  • Le chien est rarement affecté, principalement par BoDV.

La transmission chez le chat se produit surtout via le comportement de prédation des réservoirs naturels. D’autres voies possibles (contact avec sécrétions/excrétions de taupes ou de rongeurs infectés) ne peuvent être exclues, mais sont jugées moins probables.

BoDV est présent dans une aire géographique étendue, avec la majorité des cas rapportés en Europe centrale, notamment en Allemagne et dans les pays voisins, mais des cas ont aussi été décrits en Italie.
L’aire de distribution de RusV est plus restreinte, l’infection semblant être concentrée en Europe centrale et du Nord, même si des cas récents ont été signalés chez des félidés sauvages en Amérique du Nord.

Analyse génétique (PCR) chez MYLAV

De nombreux agents viraux émergents mentionnés ci-dessus peuvent aujourd’hui être recherchés et identifiés par test PCR au laboratoire MYLAV.
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Dr Nicola Decaro, DVM, PhD, Dipl. ECVM, Président de l’European College of Veterinary Microbiology
Professeur de maladies infectieuses animales – Université de Bari, Expert MYLAV en virologie et microbiologie