{"id":54822,"date":"2026-04-29T17:13:52","date_gmt":"2026-04-29T15:13:52","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mylav.net\/?p=54822"},"modified":"2026-04-29T17:13:52","modified_gmt":"2026-04-29T15:13:52","slug":"lignes-directrices-pour-la-transplantation-fecale-chez-les-animaux-de-compagnie","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mylav.net\/fr\/digestif\/lignes-directrices-pour-la-transplantation-fecale-chez-les-animaux-de-compagnie\/","title":{"rendered":"Lignes directrices pour la transplantation f\u00e9cale chez les animaux de compagnie"},"content":{"rendered":"

La transplantation de microbiote f\u00e9cal (TMF, ou FMT pour fecal microbiota transplantation<\/em>) consiste \u00e0 corriger la dysbiose<\/strong> d’un patient en lui administrant le contenu f\u00e9cal d’un donneur sain.<\/p>\n

Cette approche suscite un int\u00e9r\u00eat croissant en m\u00e9decine v\u00e9t\u00e9rinaire, avec des applications principalement en gastroent\u00e9rologie, mais aussi un potentiel en neurologie, endocrinologie et oncologie.<\/p>\n

Les \u00e9tudes disponibles restent toutefois limit\u00e9es. Des travaux compl\u00e9mentaires seront n\u00e9cessaires pour exploiter pleinement le potentiel de cette proc\u00e9dure.<\/p>\n

En m\u00e9decine humaine<\/strong>, la TMF est utilis\u00e9e avec succ\u00e8s dans le traitement des infections r\u00e9currentes \u00e0 Clostridioides difficile<\/em>, et des protocoles standardis\u00e9s existent d\u00e9j\u00e0 pour cette indication.<\/p>\n

Un article r\u00e9cent a cherch\u00e9 \u00e0 \u00e9tablir des lignes directrices en m\u00e9decine v\u00e9t\u00e9rinaire<\/strong>, dans le but de standardiser les proc\u00e9dures et de les rendre accessibles en pratique clinique quotidienne.<\/p>\n

Un \u00ab Consortium international sur la TMF des animaux de compagnie \u00bb, compos\u00e9 de v\u00e9t\u00e9rinaires sp\u00e9cialistes du domaine, a \u00e9t\u00e9 constitu\u00e9 pour fournir des informations sur les aspects techniques, d\u00e9finir les indications th\u00e9rapeutiques et pr\u00e9ciser les crit\u00e8res de s\u00e9lection des donneurs.<\/p>\n

Le document a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9 dans \u00ab\u00a0Advances in Small Animal Care\u00a0\u00bb<\/em> en 2024. Il se structure en trois sections :<\/p>\n

    \n
  1. S\u00e9lection et screening des donneurs<\/li>\n
  2. Pr\u00e9paration de la TMF<\/li>\n
  3. Dosage et administration de la TMF<\/li>\n<\/ol>\n

    Pour chacune d’entre elles, le groupe de travail a \u00e9valu\u00e9 les aspects les plus pertinents et les a class\u00e9s selon le niveau de preuve scientifique. Un niveau de preuve \u00ab \u00e9lev\u00e9 \u00bb a \u00e9t\u00e9 attribu\u00e9 lorsque les donn\u00e9es sont \u00e9tay\u00e9es par au moins un essai clinique randomis\u00e9 ; \u00ab mod\u00e9r\u00e9 \u00bb lorsqu’elles reposent sur au moins un essai clinique non randomis\u00e9, une \u00e9tude de cohorte ou une s\u00e9rie de cas ; \u00ab faible \u00bb lorsqu’elles proviennent de cas cliniques isol\u00e9s, de la pratique clinique ou d’un avis d’expert.<\/p>\n

    1 – S\u00e9lection et screening des donneurs<\/strong><\/h3>\n

    Les crit\u00e8res \u00e9valu\u00e9s portent sur l’\u00e9tat de sant\u00e9 g\u00e9n\u00e9ral des donneurs, leur \u00e2ge, leur environnement de vie, leur historique m\u00e9dicamenteux (mol\u00e9cules susceptibles d’induire une dysbiose) et les examens de d\u00e9pistage \u00e0 r\u00e9aliser.<\/p>\n

    Le crit\u00e8re ayant le plus haut niveau de preuve scientifique est l’absence de signes gastro-intestinaux au cours des 4 derniers mois, qu’ils soient aigus ou chroniques. Plusieurs \u00e9tudes ont d\u00e9montr\u00e9 que les troubles digestifs modifient le microbiote intestinal : de fa\u00e7on probablement transitoire pour les affections aigu\u00ebs, mais de mani\u00e8re durable et significative pour les formes chroniques.<\/p>\n

    Les agents pathog\u00e8nes responsables de gastro-ent\u00e9rites aigu\u00ebs du chien et du chat, transmissibles par voie oro-f\u00e9cale, peuvent \u00e9galement \u00eatre transmis par la TMF.<\/p>\n

    L’exclusion des sujets ayant pr\u00e9sent\u00e9 uniquement une symptomatologie aigu\u00eb dans les deux derni\u00e8res semaines repose en revanche sur un faible niveau de preuve : la r\u00e9silience d’un microbiote sain permet un retour rapide \u00e0 l’eubiose. L’absence d’\u00e9tudes \u00e0 grande \u00e9chelle incite cependant \u00e0 la prudence avec ces sujets.<\/p>\n

    Le d\u00e9lai minimal d’attente apr\u00e8s l’administration de m\u00e9dicaments susceptibles d’induire une dysbiose, en particulier les antibiotiques et les inhibiteurs de la pompe \u00e0 protons, fait l’objet d’un niveau de preuve mod\u00e9r\u00e9.<\/p>\n

    Les antibiotiques ont un impact majeur sur le microbiote intestinal et comptent parmi les principales causes de dysbiose. La plupart des \u00e9tudes ont port\u00e9 sur les mol\u00e9cules actives contre les bact\u00e9ries ana\u00e9robies, comme le m\u00e9tronidazole et la tylosine.<\/p>\n

    Le d\u00e9lai n\u00e9cessaire au r\u00e9tablissement d’un microbiote fonctionnel varie consid\u00e9rablement d’un individu \u00e0 l’autre et selon la mol\u00e9cule utilis\u00e9e : de quelques semaines \u00e0 plusieurs mois. Un donneur ayant re\u00e7u des antibiotiques par voie orale ou parent\u00e9rale doit donc avoir interrompu le traitement depuis au moins 6 mois.<\/strong><\/p>\n

    L’\u00e9valuation du dysbiosis index<\/em> chez le donneur est consid\u00e9r\u00e9e comme pertinente. L’analyse m\u00e9tag\u00e9nomique n’est en revanche pas jug\u00e9e indispensable, compte tenu de la variabilit\u00e9 des ph\u00e9notypes g\u00e9n\u00e9tiques observ\u00e9e aussi bien chez les sujets sains que chez les sujets malades.<\/p>\n

    Concernant les inhibiteurs de l’acidit\u00e9 gastrique, les \u00e9tudes se sont principalement int\u00e9ress\u00e9es aux effets de l’om\u00e9prazole et de l’\u00e9som\u00e9prazole, qui peuvent induire une dysbiose transitoire. Les donn\u00e9es sur les agonistes des r\u00e9cepteurs H2 sont insuffisantes. Le d\u00e9lai d’attente recommand\u00e9 entre la fin du traitement et l’inclusion comme donneur est d’environ deux semaines.<\/p>\n

    L’alimentation du donneur a aussi son importance, en particulier la consommation de viande crue. Les sujets en ayant consomm\u00e9 au cours des 30 derniers jours doivent \u00eatre exclus<\/strong> (niveau de preuve mod\u00e9r\u00e9). Ces animaux pr\u00e9sentent dans leurs f\u00e8ces une pr\u00e9valence plus \u00e9lev\u00e9e de bact\u00e9ries productrices de b\u00eata-lactamases \u00e0 spectre \u00e9tendu (BLSE), ainsi que d’ent\u00e9ropathog\u00e8nes tels que Listeria monocytogenes<\/em>, Campylobacter jejuni<\/em> et Salmonella<\/em>.<\/p>\n

    Concernant le d\u00e9pistage infectieux, une preuve mod\u00e9r\u00e9e soutient l’\u00e9valuation du dysbiosis index<\/em> comme indicateur potentiel de la fonctionnalit\u00e9 intestinale. La r\u00e9alisation d’une coproculture \u00e0 la recherche d’ent\u00e9ropathog\u00e8nes sp\u00e9cifiques est \u00e9galement conseill\u00e9e.<\/p>\n

    Le screening des donneurs pour Salmonella<\/em>, C. jejuni<\/em>, Giardia<\/em>, Cryptosporidium<\/em>, auxquels s’ajoutent chez le chat Tritrichomonas foetus\/blagburni<\/em>, le coronavirus ent\u00e9rique, le FIV et le FeLV, repose sur un niveau de preuve mod\u00e9r\u00e9. En cas de r\u00e9sultat positif, ces animaux doivent \u00eatre exclus en tant que sources potentielles d’infection.<\/p>\n

    La recherche de bact\u00e9ries du genre Clostridium<\/em> est consid\u00e9r\u00e9e comme optionnelle (preuve mod\u00e9r\u00e9e). Pour Clostridium perfringens<\/em>, facteur causal ou contributif de la AHDS (acute hemorrhagic diarrhea syndrome<\/em>), seul le screening du g\u00e8ne codant pour la toxine NetF<\/strong> est recommand\u00e9, ce facteur de virulence \u00e9tant le plus impliqu\u00e9 dans le d\u00e9veloppement de la maladie et n’\u00e9tant qu’occasionnellement isol\u00e9 dans les f\u00e8ces de sujets sains.<\/p>\n

    Clostridioides difficile<\/em> semble jouer un r\u00f4le pathog\u00e8ne moindre chez le chien et le chat par rapport \u00e0 l’humain, et la transmission intersp\u00e9cifique homme-animal ne semble pas \u00e9tablie. Sa recherche chez le chien donneur n’est donc pas recommand\u00e9e.<\/p>\n

    2 – Pr\u00e9paration de la TMF<\/strong><\/h3>\n

    Cette section fournit des indications sur la collecte et le traitement des f\u00e8ces, en insistant sur la fra\u00eecheur du pr\u00e9l\u00e8vement et la n\u00e9cessit\u00e9 de pr\u00e9server la viabilit\u00e9 des esp\u00e8ces bact\u00e9riennes.<\/p>\n

    Une fois collect\u00e9es dans un contenant adapt\u00e9, les f\u00e8ces sont soit trait\u00e9es imm\u00e9diatement, soit congel\u00e9es \u00e0 -20 \u00b0C ou -80 \u00b0C pour un usage ult\u00e9rieur.<\/p>\n

    Pour pouvoir \u00eatre administr\u00e9, le mat\u00e9riel f\u00e9cal doit \u00eatre dilu\u00e9, homog\u00e9n\u00e9is\u00e9 puis filtr\u00e9. La solution obtenue peut \u00eatre administr\u00e9e directement, dos\u00e9e et congel\u00e9e (en seringues ou en capsules), ou encore lyophilis\u00e9e et encapsul\u00e9e.<\/p>\n

    En cas de cong\u00e9lation, l’ajout d’un cryoprotecteur est recommand\u00e9. Le mat\u00e9riel d\u00e9congel\u00e9 ne doit pas \u00eatre recongel\u00e9.<\/p>\n

    L’administration peut se faire par voie orale, par lavement, par endoscopie (duod\u00e9noscopie ou coloscopie), ou par sonde d’alimentation (nasogastrique, d’\u0153sophagostomie ou gastrique), en tenant compte dans ce dernier cas du risque de pneumonie par aspiration.<\/p>\n

    Les recommandations ayant le meilleur niveau de preuve (mod\u00e9r\u00e9) sont les suivantes :<\/p>\n

    Collecte :<\/strong> chez le chien, les f\u00e8ces doivent \u00eatre recueillies imm\u00e9diatement apr\u00e8s la d\u00e9f\u00e9cation spontan\u00e9e. Chez le chat, la difficult\u00e9 \u00e0 obtenir rapidement des f\u00e8ces fra\u00eeches rend acceptable une collecte dans les 24 heures suivant la d\u00e9f\u00e9cation.<\/p>\n

    D\u00e9lai de traitement :<\/strong> les f\u00e8ces doivent \u00eatre utilis\u00e9es dans les 2 \u00e0 6 heures suivant la collecte, qu’elles soient administr\u00e9es fra\u00eeches ou congel\u00e9es.<\/p>\n

    Conditions de manipulation :<\/strong> les f\u00e8ces peuvent \u00eatre manipul\u00e9es en a\u00e9robiose \u00e0 temp\u00e9rature ambiante. Bien que ces conditions ne soient pas id\u00e9ales pour les bact\u00e9ries ana\u00e9robies strictes, elles ne semblent pas compromettre la richesse bact\u00e9rienne du pr\u00e9l\u00e8vement.<\/p>\n

    Cryoprotection :<\/strong> l’ajout d’un cryoprotecteur est indispensable pour pr\u00e9server la viabilit\u00e9 bact\u00e9rienne dans les pr\u00e9l\u00e8vements congel\u00e9s. La plupart des \u00e9tudes rapportent l’utilisation de glyc\u00e9rol \u00e0 10 % (9 mL de solution + 1 mL de glyc\u00e9rol). Aucun autre cryoprotecteur n’a \u00e9t\u00e9 test\u00e9 \u00e0 ce jour.<\/p>\n

    Recongelation :<\/strong> les cycles de cong\u00e9lation-d\u00e9cong\u00e9lation alt\u00e8rent la viabilit\u00e9 bact\u00e9rienne et sont d\u00e9conseill\u00e9s.<\/p>\n

    Les autres aspects abord\u00e9s reposent sur un faible niveau de preuve : la r\u00e9duction du risque zoonotique pour le personnel, le choix du contenant (plastique ou verre), la r\u00e9frig\u00e9ration \u00e0 4 \u00b0C en cas de traitement diff\u00e9r\u00e9, la temp\u00e9rature optimale de conservation (-20 \u00b0C vs -80 \u00b0C), le retrait des r\u00e9sidus de liti\u00e8re dans les f\u00e8ces f\u00e9lines, la m\u00e9thode d’homog\u00e9n\u00e9isation et de filtration, et la m\u00e9thode de d\u00e9cong\u00e9lation.<\/p>\n

    Le mode de dilution du mat\u00e9riel f\u00e9cal n’est pas non plus standardis\u00e9. Les \u00e9tudes rapportent l’utilisation de s\u00e9rum physiologique st\u00e9rile \u00e0 0,9 % ou de tampon phosphate salin (PBS), avec des rapports de dilution de 1:1 \u00e0 1:5 (f\u00e8ces:solvant) selon le mode d’administration et les caract\u00e9ristiques du mat\u00e9riel de d\u00e9part.<\/p>\n

    3 – Dosage et administration de la TMF<\/strong><\/h3>\n

    Cette derni\u00e8re section porte sur les applications th\u00e9rapeutiques.<\/p>\n

    Chez le chat<\/strong>, les \u00e9tudes restent insuffisantes. Il n’est pas possible de d\u00e9finir des crit\u00e8res proc\u00e9duraux pr\u00e9cis ni des objectifs th\u00e9rapeutiques clairs.<\/p>\n

    Chez le chien<\/strong>, la TMF a fait l’objet de nombreuses \u00e9tudes dans diff\u00e9rentes ent\u00e9ropathies.<\/p>\n

    En cas d’ent\u00e9ropathie chronique, la TMF joue un r\u00f4le potentiellement b\u00e9n\u00e9fique dans le cadre d’une approche th\u00e9rapeutique multimodale, la plupart des \u00e9tudes l’utilisent en association avec des traitements conventionnels. Certaines ont montr\u00e9 une am\u00e9lioration du CCECAI (Canine Chronic Enteropathy Clinical Activity Index<\/em>) et du Canine IBD Activity Index<\/em> (niveau de preuve mod\u00e9r\u00e9). La TMF a \u00e9galement montr\u00e9 un potentiel dans la colite histiocytaire, pathologie \u00e0 composante bact\u00e9rienne (E. coli<\/em> spp.).<\/p>\n

    Dans les diarrh\u00e9es aigu\u00ebs, la TMF semble raccourcir la dur\u00e9e d’hospitalisation et acc\u00e9l\u00e9rer l’am\u00e9lioration clinique, notamment chez les chiens atteints de parvovirose.<\/p>\n

    Des donn\u00e9es suffisamment solides indiquent que les formes aigu\u00ebs r\u00e9pondent \u00e0 un nombre de s\u00e9ances plus faible que les formes chroniques (en moyenne 1,8 contre 3 s\u00e9ances), bien que le nombre et l’intervalle entre les administrations ne soient pas standardis\u00e9s.<\/p>\n

    La proc\u00e9dure est globalement consid\u00e9r\u00e9e comme s\u00fbre. Les effets ind\u00e9sirables rapport\u00e9s sont rares et b\u00e9nins : aggravation transitoire de la diarrh\u00e9e, ballonnement et douleur abdominale, flatulences, dysorexie et vomissements.<\/p>\n

    Aucune \u00e9tude randomis\u00e9e ou de cohorte ne compare l’efficacit\u00e9 des diff\u00e9rentes voies d’administration chez le chien et le chat. Les \u00e9tudes v\u00e9t\u00e9rinaires portent plus souvent sur l’administration par lavement que sur la voie orale, mais les protocoles varient d’une \u00e9tude \u00e0 l’autre. Il n’est pas possible \u00e0 ce jour de se prononcer sur l’efficacit\u00e9 compar\u00e9e d’un changement de donneur ou de voie d’administration.<\/p>\n

    Les traitements r\u00e9p\u00e9t\u00e9s semblent am\u00e9liorer les r\u00e9sultats, et le maintien de la TMF dans le temps pourrait contribuer \u00e0 la p\u00e9rennit\u00e9 de l’effet th\u00e9rapeutique.<\/p>\n

    Dosage recommand\u00e9 par lavement :<\/strong> 10 \u00e0 20 mL\/kg chez les chiens de taille moyenne \u00e0 grande, et 5 \u00e0 10 mL\/kg chez les chiens de petite taille et les chats. Ces volumes ne sont toutefois pas rapport\u00e9s \u00e0 la concentration de la dilution, qui varie selon les \u00e9tudes.<\/p>\n

    Les avis divergent sur la strat\u00e9gie d’administration. Certains sp\u00e9cialistes privil\u00e9gient des volumes r\u00e9duits avec un temps de r\u00e9tention prolong\u00e9 pour favoriser l’implantation bact\u00e9rienne. D’autres estiment qu’un volume plus important favorise le contact entre la muqueuse et les bact\u00e9ries. Aucune donn\u00e9e ne tranche en faveur de l’une ou l’autre approche, ni n’\u00e9tablit qu’un temps de r\u00e9tention inf\u00e9rieur \u00e0 30-45 minutes compromette le r\u00e9sultat.<\/p>\n

    Contrairement \u00e0 la m\u00e9decine humaine, aucune donn\u00e9e ne justifie de pr\u00e9parer l’intestin du receveur par des lavements ou un traitement antibiotique pr\u00e9alable, au contraire, cela pourrait compromettre le succ\u00e8s de la TMF. Le je\u00fbne pr\u00e9-traitement est largement pratiqu\u00e9 et consid\u00e9r\u00e9 comme utile pour prolonger le temps de r\u00e9tention, mais le niveau de preuve reste faible.<\/p>\n

    Conclusion<\/strong><\/h2>\n

    Les travaux \u00e0 venir devront \u00e9tablir des crit\u00e8res fiables d’\u00e9valuation de l’efficacit\u00e9 de la TMF. Cela passera par une r\u00e9duction des variables op\u00e9ratoires : type de donneur, ph\u00e9notype clinique du receveur, modalit\u00e9s de pr\u00e9paration, de conservation et d’administration.<\/p>\n

    L’\u00e9valuation de l’efficacit\u00e9 devra int\u00e9grer l’am\u00e9lioration des signes cliniques et la r\u00e9duction du recours aux traitements m\u00e9dicamenteux (antibiotiques et immunosuppresseurs). Le dysbiosis index<\/em> ne semble en revanche pas \u00eatre un marqueur fiable chez les patients atteints d’ent\u00e9ropathie chronique, car son \u00e9volution peut ne pas suivre celle de l’am\u00e9lioration clinique.<\/p>\n

    Enrico Bottero<\/strong>, DMV., expert MYLAV en gastroent\u00e9rologie et endoscopie<\/p>\n

    Walter Bertazzolo<\/strong>, DMV, EBVS European Specialist in Veterinary Clinical Pathology (Dip. ECVCP) ; Directeur Scientifique de MYLAV<\/p>\n

     <\/p>\n

    Picture: adobestock<\/p>\n

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